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Voilà... souche Hantavirus connue... pas un GoF.
Virus classique a priori.
La première séquence complète du hantavirus du MV Hondius est 99 % identique à une souche isolée chez un patient en Argentine en juin 2018.
Taux de mutation normal : 10,4 SNV/an (substitutions nucléotidiques par an), parfaitement dans la fourchette attendue pour un hantavirus naturel (1 à 12 SNV/an).
Pas de signature de Gain-of-Function (GoF) visible pour l’instant.
Aucun site furine ajouté, aucun réassortiment suspect, aucun motif nucléotidique inhabituel. C’est une souche sauvage classique d’Amérique du Sud qui a trouvé un environnement favorable (bateau confiné + passagers âgés).
Pas de quoi devenir hystérique...
BREAKING: First sequencing of the Hantavirus from the outbreak.
-99% identical to a June 2018 case from a patient in Argentina
-10.4 SNV/year mutation rate
- The Andes genome is about 12 kb across three RNA segments. At 10⁻⁴ to 10⁻³ substitutions/site/year, that translates very roughly to 1-12 SNV per year
-Completely in line with a natural spillover in Argentina from the rodent host in 2018 and now in 2026
Source: virological.org/t/complete-s…
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Et si je reviens jamais, tant mieux !
Merci à ceux qui me suivent/m'ont suivit depuis 2 ans.
Dans ma tendance optimiste/factuel mais sans jamais etre alarmiste mais ne prétendant pas être un sachant pour autant (ce qui n'empêche pas d'avoir un avis).
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La baisse en Europe est maintenant quasi total
On a jamais eu ça en deux ans d'avoir une baisse dans tous le continent au même moment
La Russie baisse ce jour ils sont aussi arrivée en haut.
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Cette vague delta puis maintenant Omicron est maintenant bien en baisse depuis 1 semaine mais n'est pas encore sur une pente très forte (autour de -15%)
Le pic est officiellement en date du lundi 24 Janvier autour de 365 000 cas en moyenne.
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Le visage de l’épidémie change, changeons de paradigme: arrêtons de tester, isoler et tracer, poursuivons l’effort de vaccination, traitons les plus fragiles ! #covid19 @LesEchos lesechos.fr/economie-france/… via @LesEchos
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Israël est l’un des pays au monde qui a le plus fermé les écoles (jusqu’au vaccin). Les effets ont été désastreux sur les élèves, jusqu’à aujourd’hui. La France peut être fière d’avoir maintenu son système éducatif ouvert depuis la fin du printemps 2020.
"Notre préalable, c'est le maintien des écoles ouvertes ! Cela a été rendu possible grâce à l'engagement des enseignants.
Si on avait écouté les oppositions, on aurait fermé une semaine. Puis en plein rebond épidémique... une 2e semaine ? Puis une 3e ?" @publicsenat
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Enfin de bonne nouvelle avec le pic à venir?
En effet +9% en SFP
+11% en date de dimanche en SIDEP
0% en TAC hier sans doute un TAC négatif ce jour à -10/-5%
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Deux informations important via l'APHP
Avec Omicron une hospi sur deux reste 1 jour seulement hospi (contre 19% delta).
Et enfin un omicron va 3 fois moins en Soins Intensif qu'un Delta.
Mais bien sur on va attendre 15 jours au cas ou même si Omicron était en avance en IDF.
Replying to @nicolasberrod
Par ailleurs, en hospitalisation conventionnelle, 19% des patients infectés par Delta et 43% de ceux infectés infectés par Omicron sont restés pris en charge pendant moins d'un jour.
Autrement dit, les séjours de très courte durée sont plus fréquents avec Omicron.
3/
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SPF en baisse de -16% ce soir
Après -8% hier et -2% mardi.
Ca semble accélérer donc. Espérons que cela continu. 🤞
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Le très léger plateau montant continu en SPF (et donc logiquement en SIDEP)
En métropole on est passé de 20 000 cas par jour à 21 000 en deux semaines.
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Soucis de data ce soir pour le moment, pas d'open data Quelques informations quand même.
Le SPF est a 5307 soit +28%, la décélération continu. Un pic est possible dans les jours à venir et ensuite on verra si ca baisse et comment.
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Expresse du jeudi soir
SPF: 2624 -34% - 2500 de moyenne, Reff à 0.59
La baisse semble bien ralentir en cette fin de semaine.
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Nous avons besoin de renforts au centre de #vaccination du Palais des sports de Lyon - Gerland.
Infirmier / Infirmière diplômée d’état, étudiants & étudiantes en soins infirmiers ou MEM... rejoignez la #TeamHCL, candidatez jusqu'au 1er juin
🔵chu-lyon.fr/fr/recrutement-c… #Emploi
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🆕📱 L'application 〽️Météo-Covid est maintenant disponible sur Android !
Développée par @clemsciences (merci 🙏), vous pouvez choisir votre département favori et recevoir une notification lorsque les mises-à-jours sont disponibles.
A télécharger ici 👉bit.ly/3tmgeoM
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[THREAD]
2⃣7⃣7⃣ème bulletin #MétéoCovidFrance du 02 avril
Nouveaux cas SPF en date de déclaration
📈46677 (+11,48% vs j-7)
📈39400 en moyenne (+10,65% vs j-7)
La hausse à J-7 ralentie très (trop) légèrement, on reste donc globalement toujours sur une hausse des cas.
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Parce que la #Covid19 fait la 🌧️ & le☀️de vos sorties, consultez la #MeteoCovid près de chez vous
> situation sanitaire décryptée en 11 émojis #trouillomètre #TrouilloCarte
> indicateurs taux de vaccination (+comparatif à l'international)
#WorldMetDay
🔗bit.ly/3f36A77
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Les données #Covid19, habituellement connues vers 17h-17h30, ne sont pas encore en ligne. D'après une source interne, il n'est "même pas sûr" qu'elles arrivent ce soir, à cause de soucis technique.
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Sans aucune doute la personne qui analyse le mieux des données. Sans esprit partisan. Merci @Fabien_L!
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Nombre de cas à date de prélèvement mercredi 24000 : soit 6% de plus que mercredi dernier (23500)
Le ralentissement de l'accélération se poursuit
16% lundi, 13% mardi et donc 6% mercredi. Il est possible que le chiffre de jeudi soit au même niveau que jeudi dernier (23300)




























