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このpodcastは、さまざまな形で分子デザインに携わるメンバーが、分子デザインについてゆるく語りつつ情報発信する番組です。タンパク質デザインや核酸 (DNA/RNA)デザインが主なトピックです。 https://xitter.gq/t.co/exoA73iawc

Joined March 2024
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今回から、ハンズオンの動画を Youtube でも公開しています!ぜひチャンネル登録をお願いします! Youtube チャンネル「分子デザインはじめました」 youtube.com/channel/UCuDtDoN… Ep26-3: [Hands-on] Proteina Complexa tutorial youtube.com/watch?v=b9cXLQNn…
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Podcast #分子デザインはじめました、Apple Podcasts にも対応し、Spotify、Apple Podcasts、Pocket Casts、Overcast など各種アプリでお聴きいただけます! 各種デザイン手法、論文、実験機器などへのリンクは show note から。気になるところからのご視聴に、チャプターもご利用ください!
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【📢お知らせ📢】 Podcast「#分子デザインはじめました」のホームページを公開しました🎉 ・エピソードごとにPodcast、YouTube、ショーノートを1ページに集約 ・トップのキーワード検索で気になるエピソードを検索できます 聴きたい形式で、聴きたい回からぜひ! ▶︎ sites.google.com/view/podcas…
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Podcast #分子デザインはじめました の最新回は、自己紹介/キャリア雑談回でした。研究室決めのトランプで7分の1を引き当てた話や、進学先をとても悩んだ頃のことを話しました。研究を志すきっかけもタイミングも三者三様で、楽しくも勉強になる収録でした!
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新しいエピソードです! 3年目にしてまさかの自己紹介回 (全4回)です笑 第1回は就活・博士課程進学をどうやって決めたのかについて、かなりぶっちゃけております!
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Ep 27-1 では、研究室選び、学振申請、留学準備などについて話しています。 また、オープニングでは、AlphaProtein Novo, RFD4-Proteina, ArcRefine などのトピックを紹介しました。
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【📢お知らせ📢】 Podcast「#分子デザインはじめました」のホームページを公開しました🎉 ・エピソードごとにPodcast、YouTube、ショーノートを1ページに集約 ・トップのキーワード検索で気になるエピソードを検索できます 聴きたい形式で、聴きたい回からぜひ! ▶︎ sites.google.com/view/podcas…
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こちらのProteína-Complexa、南慎太朗さん@shintaro_minami が手軽に試せるColab notebook版を公開され、私たちのPodcastでそのチュートリアルを配信しましたので、気になった方はぜひ! ちなみに構造と配列の同時生成は「co-design = コデザイン」がより正確な表記ですね! xitter.gq/Biomol_Design/status/2…
Nvidiaのタンパク質デザインツール 構造とアミノ酸配列を同時生成する「コードデザイン」と、最適な候補を絞り込む「潜在生成検索」を組み合わせたNvidiaのProteína-Complexa実証論文。これまで困難だった糖鎖などの標的に対するバインダー生成などを可能に biorxiv.org/content/10.64898…
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今回から、ハンズオンの動画を Youtube でも公開しています!ぜひチャンネル登録をお願いします! Youtube チャンネル「分子デザインはじめました」 youtube.com/channel/UCuDtDoN… Ep26-3: [Hands-on] Proteina Complexa tutorial youtube.com/watch?v=b9cXLQNn…
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今回のチュートリアルでは、 ・Proteina Complexa の特徴 ・Colab Notebook の使い方 ・モデルパラメーターのダウンロード ・Branch search のオプション ・結合 Hot Spot の選び方 ・バリデーションに用いる構造予測モデル ・バックボーン多様性の重要性 などについて解説しています。
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南さんインタビュー後半です! AIエージェントを使ったデザインプロジェクト管理のTipsやデザイン手法開発の今後について話しました!
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南さんインタビュー後編!!Claude codeで設計ツールなどを作っていた最中の収録でとても勉強になりました!!Obsidianはまだ手が出せていません。(その後、Claude codeを回していたデスクトップPCが2台同じエラーで壊れるという…。)
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Podcast #分子デザインはじめました、南さんインタビュー回の後編がリリースになりました! バインダーのリデザインの話から、構造予測モデルの今後、タンパク質の配列・構造・機能の関係、構造をとらないタンパク質の扱いなど、情報と物質の狭間のお話が大変勉強になりました!
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Podcast #分子デザインはじめました、Apple Podcasts にも対応し、Spotify、Apple Podcasts、Pocket Casts、Overcast など各種アプリでお聴きいただけます! 各種デザイン手法、論文、実験機器などへのリンクは show note から。気になるところからのご視聴に、チャプターもご利用ください!
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Podcast で南慎太朗さんにインタビューさせていただきました! 最新のタンパク質デザイン手法やクラウドコンピューティングの活用、バイオスタートアップでの働き方や、3年分を1ヶ月でというスピード感などなど、大変勉強させていただきました! 近日公開予定の後編もぜひ!
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De novoタンパク質デザインによる創薬の最前線で活躍されている南さんにお話伺いました! 気になる最新デザイン関連手法や、新しい手法を取り入れる時どうしているかなど、実践的な内容も盛りだくさんの回になっております!
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今回は、インタビュー回前編です。後編も乞うご期待!
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